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STR鑒定

細(xì)胞STR鑒定應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的哺乳動物細(xì)胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題,一直是一個普遍存在的突出問題。

據(jù)統(tǒng)計,國外實(shí)驗(yàn)室有20%左右的細(xì)胞株被錯誤鑒定和交叉污染,NIH和ATCC近兩年都對此發(fā)出呼吁,要求研究者對細(xì)胞進(jìn)行鑒定。近年來,大量研究表明STR基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的最有效和準(zhǔn)確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈推薦。美國的ATCC細(xì)胞庫、德國的DSMZ細(xì)胞庫以及日本的JCRB細(xì)胞庫等為STR分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對。

STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因位點(diǎn)由長度為3-7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

我們?yōu)檫M(jìn)一步提高鑒定的分辨率,除了包含ATCC檢測的8個STR和1個性別決定位點(diǎn)Amelogenin外,另新增了12個高度多態(tài)性位點(diǎn),共檢測21個STR位點(diǎn)。

送鑒定樣本要求:

細(xì)胞樣本:一瓶活細(xì)胞 ,細(xì)胞數(shù)≥106 cells ;凍存細(xì)胞,細(xì)胞數(shù)≥106 cells ;細(xì)胞沉淀,細(xì)胞數(shù)≥106 cells

DNA樣本:OD 260/OD 280=1.8-2.0 ; DNA濃度≥50 ng /μL , DNA體積≥20 μL (凍存細(xì)胞,細(xì)胞沉淀,DNA樣本,請低溫運(yùn)輸! )

客戶需要提供細(xì)胞樣品,管壁標(biāo)記清楚細(xì)胞的名稱,數(shù)量較多時要標(biāo)好標(biāo)注,并附送鑒清單。

每次鑒定的周期為1周,具體細(xì)節(jié)請與相關(guān) 客服人員溝通好。

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